Elenco Pokémon secondo il Nuovo Pokédex
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Questa è la lista dei Pokémon ordinati secondo il Pokédex Regionale di Johto nella seconda generazione; ciò significa che i Pokémon iniziali di Johto appariranno per primi, seguiti da tutti gli altri Pokémon nativi delle regioni di Kanto e Johto, ordinati diversamente dal Pokédex Nazionale, a seconda delle loro evoluzioni.
Poiché molti dei Pokémon nativi di Johto sono anche nativi di Kanto, nella maggior parte questo è semplicemente un elenco riordinato di Pokémon per sistemare vicini i Pokémon relativi ad una stessa catena evolutiva. Ad esempio, in questo schema Pichu compare subito prima di Pikachu e Raichu e Scyther viene subito prima di Scizor.
Questo Pokédex ordinato potrebbe essere considerato il precursore dei meglio definiti Pokédex regionali della terza e quarta generazione e dell'elenco Pokémon per habitat delle versioni Rosso Fuoco e Verde Foglia. A differenza degli altri Pokédex regionali, comprende anche tutti i Pokémon sia di Kanto che di Johto, sistemando quelli che non appaiono in Johto in fondo alla lista.
È interessante che, riguardo all'ordine dei Pokémon, nel gioco non si fa mai riferimento al "Pokedex di Johto", che viene invece chiamato "Nuovo Pokédex", mentre l'ordine nazionale viene definito "Vecchio Pokédex". Questa particolarità è stata eliminata nei remake della quarta generazione (il cui Pokédex è definito esplicitamente "Pokédex di Johto"). Nel Pokédex di Oro HeartGold e Argento SoulSilver, infatti, l'ordine è stato leggermente modificato per permettere l'inclusone dei cinque Pokémon di quarta generazione che evolvono da Pokémon di Prima e Seconda generazione imparando una mossa (ossia Lickilicky, Mamoswine, Tangrowth, Yanmega e Ambipom), dato che tale mossa viene imparata automaticamente.
La nuova numerazione è la stessa di quella vecchia fino al n°101 (Yanma), ma cambia a partire dal n°102, che nella Seconda generazione corrisponde a Sunkern, mentre nel Pokédex di Johto della Quarta è assegnato a Yanmega.
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